Jurusan Akuntansi Politeknik Negeri Medan mulai menerima mahasiswa pada bulan September 1986. Semula Jurusan Akuntansi tergabung dalam Jurusan Tata Niaga (Commerce Division) Politeknik USU. Pada tahun 1991 Jurusan Tata-niaga di mekarkan dengan mendirikan Jurusan Akuntansi dengan mengasuh 2 program studi, yaitu Program Studi Akuntansi dan Program Studi Perbankan dan Keuangan dan Jurusan Administrasi yang mengasuh Program Studi Administrasi Bisnis berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No. 0313/O/1991 pada tanggal 6 Juni 1991.
Saat ini Jurusan akuntansi telah mengelola 5 program studi yang terdiri dari:
Program Studi Magister Terapan Sistem Informasi Akuntansi, Program Studi D4 Keuangan dan Perbankan Syariah, Program Studi D4 Akuntansi Keuangan Publik, Program Studi D3 Perbankan dan Keuangan, serta D3 Program studi akuntansi.
Berdasarkan data akreditasi program studi dari Lembaga akreditasi BAN PT, Jurusan Akuntansi memperoleh Akreditasi B untuk empat program studi, yaitu: Seluruh Program Studi telah memperoleh akreditasi B, dan Program Studi Magister Terapan Sistem Informasi Akuntansi, Program Studi D4 Keuangan dan Perbankan Syariah, Program Studi D4 Akuntansi Keuangan Publik, serta D3 Program studi akuntansi. Sedangkan Program Studi D3 Perbankan dan Keuangan mendapatkan akreditasi A, selama 3 periode berturut turut sejak tahun 2005 hingga tahun 2021.